Morir soñando

Morir soñando, sí, mas si se sueña 

morir, la muerte es sueño; una ventana 

hacia el vacío; no soñar; nirvana; 

del tiempo al fin la eternidad se adueña. 

Vivir el día de hoy bajo la enseña 

del ayer deshaciéndose en mañana; 

vivir encadenado a la desgana 

¿es acaso vivir? ¿y esto qué enseña? 

¿Soñar la muerte no es matar el sueño? 

¿Vivir el sueño no es matar la vida? 

¿A qué poner en ello tanto empeño?: 

¿aprender lo que al punto al fin se olvida 

escudriñando el implacable ceño 

-cielo desierto- del eterno Dueño?

Miguel de Unamuno

Llega el frío invierno

Se acerca el final de otro año, 2016, del que ya hablaremos más adelante. Hoy he aprovechado para publicar una de las entradas que tenía pendientes, el microrrelato presentado a Universos Mínimos IX, el de este año. Concurso en el que, los que me seguís hace tiempo ya sabéis que me gusta participar anualmente. Una vez más, como es lógico, mi relato no ha sido seleccionado así que, una vez difundido el fallo del jurado os publico por aquí para que podáis "disfrutarlo" o lo que sea que hagáis los que aún entráis en esta mazmorra de incoherencias.

Tengo pendiente una entrada, que quiero que quede bien, y que será publicada con fecha anterior a la liberación de la misma, por razones que ya entenderéis en su momento.

Si, ya se que parece que solo hablo de entradas que vendrán, como otras muchas veces, pero es que cuando quiero ponerme a escribir nunca tengo tiempo y cuando tengo tiempo... la verdad es que no tengo ganas. Al final las cosas se van enquistando y... bueno, pasa lo que pasa.

Poco más puedo deciros hoy a parte de que llegó el invierno y, como buen cambio de estación, os dejo por aquí la, ya tradicional, canción de animación, Disney Fairies casi siempre, para ilustrarlo. Espero que no tardéis mucho en tener noticias otra vez. Tengo la sensación de que, la poca cordura que me quedaba, se va perdiendo cada vez que no escribo.

Sinuosa Musa

Sinuosa Musa

¿Cómo pueden las simples letras

alzarse en tormentosas olas?

¿Es factible

ver un patrón en el océano?

Reconocerlo

como tu barrio

de la infancia.

Recorrerlo entero,

sin bote, velero, ni lacha,

y sin caer rendido

en medio de su inmensidad.

Todo es posible,

con la musa adecuada.

Hasta siempre Tío Antonio

Esta, nuestra especie, ha sufrido hoy una gran pérdida. Nos ha dejado Don Antonio Sierra Calvo, el hermano de mi abuela, y un gran referente para mi, tanto a nivel personal como académico. 

Salmantino de nacimiento, estudió medicina en nuestra pequeña ciudad, con el reto de que sus estudios le generasen el menor gasto posible a sus padres. Consiguió una ingente cantidad de matrículas de honor así como el Premio Extraordinario y la primera posición del primer MIR en Vigo. Desarrolló toda su actividad médica allí, donde atendió a más de 50000 pacientes.

Yo siempre le conocí como mi "Tío Antonio", una bellísima persona, que nunca dejó de interesarse por la ciencia, las maravillas de la vida y, en sus últimos años, por la física cuántica. Ójala algún día consiga parecerme mínimamente a él, de momento espero terminar una tesis de la que podría haberse sentido orgulloso.

Hasta siempre Tío Antonio.

El viaje del DNA

Hoy me encontré con este vídeo en mi paseo habitual por las redes sociales. Ya sabéis que a veces os comparto algunos vídeos virales aunque no suelen ser santo de mi devoción. En este caso en concreto encuentro dos problemas importantes.

El primero es que el propio experimento que definen parte de un error de base. La práctica totalidad de los seres humanos de la tierra contienen DNA de todo el mundo. Es posible que en alguna tribu muy antigua y aislada de Africa se pudiera encontrar "DNA puro" pero la propia definición de "alemán", "americano" o "asíatico" es ridícula. Los seres humanos no vivirían en esas regiones si hace miles de años algún homo sapiens, de otro lugar del mundo no hubiera llegado allí.

El segundo es que se trata de un vídeo publicitario de una empresa de viajes. Muy lacrimógeno y bien montado pero un anuncio al fin y al cabo. De hecho tienen continuaciones en un canal de Youtube creado a tal efecto.

Una vez comentados los problemas quiero expresar por qué lo comparto por aquí. Creo que es una forma muy gráfica de demostrar precisamente el hecho descrito como primer problema. Que no existen razas puras. Que toda esa ridiculez de los "supremacistas blancos" no es más que la expresión más absoluta de la ignorancia social y humana. Y en una interpretación mucho más abierta, que las fronteras, países y demás tienen cada vez menos sentido ya que las diferencias culturales, que son lo que verdaderamente define a las naciones, son cada vez menores a la vez que aprendemos, como especie, a tolerarlas.

Son conceptos que cualquier persona con un poco de cultura y dedos frente entiende y asume hace ya bastante tiempo. Pero, por desgracia, la inmensa mayoría de nuestros congéneres no piensan igual, o directamente es que no piensan nada. Por ello creo que es bueno que algo como esto se viralice. De hecho creo que sería muy interesante que se hiciera en la realidad, que se le demostrara a la gente lo que dice su "historia genética" y entendiesen de una vez que no somos tan diferentes. Que aunque con todos los nucléotidos que separan a un ser humano de otro se podría escribir el genoma completo de una levadura, en realidad eso no representa más que una pequeña, ínfima fracción de las instrucciones necesarias para crear a cada uno de nosotros.

P.D.

Para comprobar esa "historia" no es necesario hacer una secuenciación del genoma completo como dicen en el libro y como piensa cualquier lego en la materia cuando oye las palabras "secuenciación de ADN". Sólo se miran algunas partes concretas y pequeñas del mismo. Estaría genial disponer de la información completa pero sería muy caro y, por tanto, inmanejable para un experimento social o una herramienta educativa.

Lo que significa pintar nucleosomas

Hoy Facebook me trae un recuerdo de hace 4 años. No me gusta nada esa funcionalidad de la red social, no de dan cuenta de que es posible que haya cosas que la gente no quiera recordar o, simplemente, no es saludable estar todo el tiempo rememorando el pasado. Por ello no suelo recompartir ninguno de sus recuerdos. 

Se trata de el primer mapa de nucleosomas que di por pintado, de principio a fin, desde la nada, llevando a cabo todo el proceso con un sólo programa realizado por mí, portando código de otra persona escrito en varios lenguajes diferentes. La idea era poder llevar a cabo el proceso completo en un solo paso. Es probablemente el primer programa, que se pueda considerar como tal, que realicé el Python. 

He querido hacer una reflexión sobre lo que significa analizar datos génomicos y lo que no. En el fondo sobre la importancia de que el trabajo experto lo realicen los... ¿expertos se llamaban? ¿no? Y es que no se puede permitir todo en el mundo de la investigación, porque luego pasa lo que pasa, como hemos visto recientemente en distintos medios:

http://elpais.com/elpais/2016/07/26/ciencia/1469532340_615895.html
http://omicrono.elespanol.com/2016/07/error-software-resonancia-magnetica/
http://www.nature.com/news/good-data-are-not-enough-1.20906
http://massgenomics.org/2015/10/ngs-analysis-not-free.html

Y no solo hablando de análisis, actualmente vivimos inmersos en una auténtica Crisis de Reproducibilidad:

http://www.nature.com/news/reproducibility-1.17552
http://www.sheldrake.org/about-rupert-sheldrake/blog/the-replicability-crisis-in-science

Siempre hay que tener 1000 ojos. Recientemente yo me he encontrado con datos proporcionados por una empresa especializada en secuenciación y análisis que presentaban errores de interpretación de importancia.

Por eso hace falta poner mucho cuidado y conocer al dedillo todos y cada uno de los entresijos de lo que se analiza. De hecho, cualquier persona puede convertirse en experto con mucho esfuerzo y tesón. Hace falta repetir y repetir. Hace falta, en el caso concreto que nos ocupa, pintar muchos datos de la literatura, que ya están pintados, y ver que sacas las mismas conclusiones, y ser crítico para saber que, aunque lo hayas podido reproducir, si has entendido completamente el proceso y consideras que puede haber errores, mejorarlo. Y también hace falta recorrer los datos y conocerlos casi como si fueran hijos tuyos, porque esa es la única manera de detectar errores en conjuntos de número que contienen millones de elementos todos con un aparente sentido. La, tan denostada, inspección "a ojo" es muy útil a la hora de entender e intepretar resultados. Y también para poder diseñar las "preguntas" que hacer a continuación.

Hay que preguntar que si fueras un científico que quisiese publicar sus investigaciones ¿enviarías a las revistas datos que no comprendes todos los pasos por que pasan? Pues eso es lo que ocurre en gran parte de la ciencia mundial, se confunde el periodo formativo con el periodo experto y al final, la ciencia no avanza con paso firme, avanza a pesar de todo lo que se va publicando. Claro que si las revistas contasen con personal especializado en revisar los materiales y métodos paso a paso bajarían mucho su índice de publicación (y como parte negativa para los autores, se incrementaría aún más el interminable periodo de revisión). Pero bueno, eso ya es otra historia.

Avanzando, poco a poco

Nunca me había visto repitiendo, tan a menudo, "poco a poco". Pero es así, la tesis va "poco a poco", muy poco a poco, pero eso si, siempre adelante. El viernes pasado consideré que el primer cuarto ya estaba enseñable y lo envié para que se sometiera al duro escrutinio. En realidad, si tenemos en cuenta lo realmente complicado y no sólo las páginas finales, se podría considerar que era más de un cuarto, puede que incluso más de un tercio pero, en cualquier caso, cada página que se va creando lleva gotitas de sangre.

Me gustaría haber podido realizar una tesis de una forma un poquito más tradicional, pero la vida es como ocurre y no como nos gustaría que ocurriera. Y hay que seguir, poquito a poco y siempre hacia delante. Por suerte puedo decir que me va gustando cómo está quedando, parece lo que yo entendería por una tesis interesante y legible algo que, teniendo en cuenta las circunstancias, es más de lo que se podría pedir.

Hay días que se hacen bastante pesados porque parece que la inspiración no llega, parece que no estás haciendo nada, pero la mayor parte de ellos se va empujando en la dirección correcta. Eso si, los momentos en los que lo ves todo negro y absurdo también acompañan.

Hay que agarrarse a pequeñas cosas. Cosas como lo bonitas que ves que te van quedando las figuras que consideras definitivas, aunque te las vayan a hacer retocar una y mil veces por chorradas, los preparativos para el, cada vez más cercano, retorno a Japón, el apoyo de otros investigadores que te ayudan a levantarte tras las zancadillas del camino... Hay cosas, por suerte.

Pero bueno, no todo va a ser tesis ¿no? Hoy se acababa el plazo para presentar los microrrelatos a Universos Mínimos IX y ya está en camino. Para haberlo escrito en tan poco tiempo, me ha gustado bastante cómo ha quedado. Como todos los años, cuando el jurado emita su decisión, lo publicaré por aquí para que lo podáis leer.

Por fin estoy terminando mi "penitencia" con el Quijote, y antes de plazo. Ya me queda poquito para terminar la segunda parte y por fin quedaré libre. Hasta el próximo 'clásico' que me atreva a coger :S, pero bueno, dije que lo terminaría y así va a ser, ya no queda nada.

Y en cuanto a juegos, pues la verdad es que juego muy poquito, pero llevo una buena época, disfrutando de los que me van tocando. Ahora mismo estoy acabando el Life is Strange, que le tenía muchas ganas hace tiempo y no me ha defraudado para nada, todo lo contrario. Me está gustando muchísimo y ya os hablaré de él en breve, que también hace mucho que no hago ningún análisis.

Por hoy esto es todo, espero no haberos aburrido mucho. Se nota que con esto de la tesis estoy volviendo a escribir bastante, jeje.

Agravada soledad

Hace casi un año que no escribo absolutamente nada en este blog, y prácticamente en ningún sitio. Soy de números exactos y podría calcular los días concretos que hace pero... la verdad es que no me apetece. Si diré que faltan 19 días para que se cumpla un año de una entrada en la que decía que tenía una sensación de soledad...

¿Por qué no he escrito en todo este tiempo? Por muchas razones, muchas excusas, pero lo mas importante supongo que es porque... no podía. Porque esa sensación de soledad se ha afincado y agrandado de forma increíble. Y es curioso porque probablemente haya sido una de las épocas de mi vida en la que he tenido más personas "cercanas" a mi alrededor. Claro que siempre se me dio especialmente bien "estar sólo en medio de un montón de gente".

Tengo la losa encima de que en realidad no puedo hablar realmente con nadie porque nadie va a escuchar y comprender lo que pasa por mi cabeza, lo que me sume en esta oscuridad tan espesa. Si habrá psicología barata, o cara, en medio. Habrá mucha falsa comprensión o preocupación, pero no lo que verdaderamente necesito. Y no es que busque escuchar alguna cosa concreta, no, buscar la aprobación de los demás no es algo que vaya conmigo ni que nunca haya hecho.

Todo este tiempo ¿qué ha ocurrido? Muchas cosas y ninguna en realidad. Sí, científicamente he publicado varios artículos más, he emprendido una nueva aventura, me he inmolado para ganar una batalla que no creo que merezca la pena, he empezado a escribir una tesis doctoral que no se si algún día llegaré a terminar y que, por supuesto, lo único que me trae es sentimientos de un pasado que prefiero olvidar. Y, por supuesto, me he equivocado en todo, en absolutamente todo ¿qué otra cosa podía hacer? ¿Acaso había un movimiento no erróneo? Se que visto desde la perspectiva de un espectador externo es posible que no sea así, y que las decisiones no se puedan valorar como exitosas o erróneas. Naturalmente siempre he tratado de elegir lo mejor con la información disponible, no sabría actuar de otra forma. ¿Entonces por qué siento que no he tomado ninguna buena decisión en las últimas... decadas? Si es que alguna vez he hecho algo bien, claro...

Me duelen cada día más las injusticias, las personales y las universales. Todas aquellas cosas que, pudiéndose hacer bien, se hacen horriblemente mal. No entiendo el mundo en el que vivo, me ha sobrepasado, me ha superado la gente que es incapaz de ser quien es sólo por el miedo a los demás. Me duele la vida misma y no tengo muy claro por qué seguir en ella si, al fin y al cabo, nunca voy a estar realmente vivo.

Y no quiero que se entienda mal a lo que me refiero con "soledad". Como ya he dicho arriba, no es que haya faltado gente buena a mi alrededor, todo lo contrario. Ni siquiera es que yo quiera o tenga necesidad de no estar físicamente solo, eso es algo que nunca me ha preocupado. Me refiero a la soledad del alma, que es la más difícil de asimilar, y la más horrible de padecer.

En fin, supongo y espero recuperar la escritura de este blog porque necesito la inspiración que no he tenido estos largos meses para escribir una tesis con la que cerrar un ciclo grande, largo y pesado...

Había de morir tarde o temprano;

alguna vez vendría tal noticia.

Mañana,

y mañana, y mañana

se arrastra con paso mezquino día tras día

hasta la sílaba final del tiempo escrito,

y la luz de todo nuestro ayer

guió a los bobos hacia el polvo de la muerte.

¡Apágate,

apágate breve llama!

La vida es una sombra que camina,

un pobre actor que en escena se arrebata y contonea

y nunca más se le oye.

Es un cuento que cuenta un idiota,

lleno de ruido y de furia,

que no significa nada.

- William Shakespeare