Preguntas sin respuesta (sencilla) VII

Esto... en verano, aquí, en la ciudad, siempre hay un ciclo de música en directo en las zonas monumentales... Hoy empieza el de este año y me preguntaba si... bueno si te apetecería venir conmigo...

Base composition and nucleosomal organization of the Schizosaccharomyces pombe genome

Base composition and nucleosomal organization of the Schizosaccharomyces pombe genome

Luis Quintales, Ignacio Soriano, Enrique Vázquez, Francisco Antequera*

Instituto de Biología Funcional y Genómica
Consejo Superior de Investigaciones Científicas (CSIC)/Universidad de Salamanca
Campus Miguel de Unamuno
37007-Salamanca. Spain

Nucleosomes are the basic units of chromatin. They facilitate the packaging of the eukaryotic genome inside the nucleus and modulate the access of regulatory proteins to DNA either directly or through the epigenetic modification of histones. To study the contribution of nucleosomes to genome regulation in S. pombe, we have generated high-resolution maps that allow precise localisation of individual nucleosomes. Our results show that regular nucleosomal arrays extend upstream from the nucleosome depleted region present at the 5’ end of many genes and downstream from the transcription termination site. Nucleosome positioning is also present along genes that show low or undetectable levels of transcription. Different patterns are obtained depending on whether the genomic position used to generate the aggregated nucleosomal profiles is localized inside the transcribed units or at their 5’ or 3’ end. These results indicate that regular nucleosomal arrays are

widespread along the genome and do not necessarily represent a specific feature of the 5’ end of the genes. We have also found that the nucleosomal profile overlaps with periodic oscillations in the A+T content of the underlying DNA sequence, which suggests a stable association between nucleosomes and some specific regions of DNA. The implications of these observations for the organization and the evolution of the genome will be discussed.

Keywords:
Presented by: Antequera, Francisco
Presentation type: Invited speaker
Session: DNA metabolism, chromatin, gene expression

On my own - Samantha Barks - Eponine

Llevaba tiempo queriendo encontrar esta canción (es el problema de no ser un fanático de los musicales xD). Fue la canción que más me gustó de la película de Los Miserables, espero que a vosotros también os guste un poquito.

On my own

Pretending he's beside me

All alone

I walk with him till morning

Without him

I feel his arms around me

And when I lose my way I close my eyes

And he has found me

In the rain the pavement shines like silver

All the lights are misty in the river

In the darkness, the trees are full of starlight

And all I see is him and me forever and forever 

And I know it's only in my mind

That I'm talking to myself and not to him

And although I know that he is blind

Still I say there's a way for us 

I love him

But when the night is over

He is gone

The river's just a river

Without him

The world around me changes

The trees are bare and everywhere

The streets are full of strangers

I love him

But every day I'm learning

All my life

I've only been pretending

Without me

His world will go on turning

A world that's full of happiness

That I have never known

I love him

I love him

I love him

But only on my own

Una horrible sensación

Hoy no ha sido una mala tarde, ni una mala noche, incluso no podría decir que haya sido una "mala" semana, aunque ha sido increíblemente larga. Sin embargo, ahora mismo, tengo una sensación horrible encima.

No sabría decir muy bien qué es lo que siento, ni porqué se que es algo malo. De hecho sería muy fácil culpar a la luna de todo, ya que está más cerca que nunca ¿no?; o a... lo que sea. Pero lo cierto es que este abatimiento no se debe a fuerzas sobrenaturales, ni a nada lejano.

Es algo de dentro, de muy dentro; una de esas "corazonadas" que te dicen que todo va a salir mal, da igual lo que sea, hagas o no hagas nada, cualquier cosa, grande o pequeña, importante o insignificante, va a ir mal, absolutamente mal.

Hay fuerzas que se están agotando y que ya ni la inercia puede mantener. Ya no hay manera de rebañar más el cuenco, todo se ha derramado, evaporado... La Caja de Pandora ha pasado abierta demasiado tiempo y ya no queda ni la esperanza.

¿Acaso algo iba a cambiar?

¿Qué pasa? ¿Qué ocurre? ¿Por qué no se crea el callo? ¿Por qué esta desolación? ¿No se suponía que el ánimo gris era por los días grises? No tengo respuestas y el problema es que ya no las tengo tampoco para problemas más sencillos, esta mañana he sido incapaz de hilar lo suficiente de mi pensamiento como para resolver un problema que antaño me habría resultado... bueno, al menos no me habría parecido tan terriblemente complicado.

Se acerca un verano muy complicado, un verano en el que he de decidir una serie de cosas bastante importantes, y no cuento con ningún tipo de ayuda para ello. ¿Cómo decidir anclarme a la monotonía un año más si cada día que pasa es una horrible montaña que escalar? ¿Cómo... cómo... cómo renunciar a dos sueños al mismo tiempo, aunque, por lo visto, uno no lo merezco y el otro... bueno, supongo que molesto a demasiada gente.

Llevo ya muchos años tratando de encontrarme a mi mismo. Bueno, no, realmente no es eso. Realmente me encontré hace mucho tiempo, al menos la mayor parte de mi, pero ahora estoy perdido, porque hay cosas, bastantes cosas que no entiendo.

Me conozco bien, demasiado bien como para saber qué límites no estoy dispuesto a traspasar. Como para saber que si los traspasara, o si los hubiera traspasado, probablemente ahora alguno de mis "problemas" no sería tal y habría conseguido alguna de esas cosas que anhelo con todo aquello que me hacer estar vivo. Pero se que así no podría reconocerme a mi mismo.

Supongo que da igual ¿no? Siempre ha dado igual... Yo seguiré siendo ese imbécil que está ahí y nada más. Es el problema de ser un looser y no ser el protagonista de ninguna historia, de ningún cuento de hadas. En la vida real los perdedores no son asesinos de reyes, ni invocan al fuego y al rayo.

Se encuentran con Felurian y sólo pueden admirarla en la lejanía...

Kingdom Hearts en el E3 de 2013

Y finalmente apareció, el Elegido de la Llave Espada ha vuelto este E3 cuando ya nadie lo esperaba. Venía siendo un poco como The Last Guardian. Bueno, no, que este al menos no lo han cancelado xDD. Ahora en serio, era un secreto a voces.

Días antes se había filtrado el logotipo y, bueno, ya no podían retrasarlo más. Por si alguien aún no se ha dado cuenta, estoy hablando del Kingdom Hearts III, el juego que concluirá la historia de Xeanorth (a falta de ver qué pasa con el Birth By Sleep Volume II).

Éste fue el trailer que mostraron en medio de la conferencia de Sony, a las 4:30 de la mañana. En esos momentos yo me estaba planteando si me había merecido la pena quedarme a seguir la conferencia pero al ver este vídeo se me pasaron todas las dudas:

Sí, se que ese mensaje del final del vídeo implica que los japoneses no verán el juego hasta 2015 por lo menos, lo que nos deja a los occidentales muy muy lejos del lanzamiento del mismo. Y si, se que no son más que unos segundos. Pero ya estamos un poco más cerca del lanzamiento.

¿Qué decir del vídeo en si? Pues poco se puede añadir. Ese momento de gameplay con gráficos y movimientos que hacen llorar a las cinemáticas de su primera entrega. Ese momento en que Sora recoge la Llave Espada de Terra... Bueno, es Kingdom Hearts III sólo esperemos que Square no la cague esta vez.

Como no todo iba a ser bueno, en esta ocasión se han decidido por desarrollarlo multiplataforma, para PS4 y Juan, a ver si no se marcan un Final Fantasy XIII, claro que en esta ocasión el desarrollo "multi" casi no es tal ya que arquitectónicamente ambas máquinas son muy similares, por no decir idénticas.

Pero ésto no es lo único que hemos podido ver de Kingdom Hearts este E3, Square también ha liberado un nuevo trailer de Kingdom Hearts 1.5 HD Remix en su versión occidental. Y es que en Japón lleva ya unos cuantos meses lanzado, pero bueno, al menos esta vez nos va a llegar, y poco más podemos pedir.

Esta reedición en alta definición de Kingdom Hearts, Kingdom Hearts: Re Chain of Memories y los vídeos de Kingdom Hearts 358/2 Days que será lanzada para PS3 tiene muy buena pinta y debería ser un indispensable para todo aquel que aún no haya disfrutado de la saga.

Bien es cierto que gracias a los emuladores modernos se lleva pudiendo disfrutar de las versiones en 1080p de los juegos de PS2 desde hace mucho tiempo. Yo, de hecho, me pasé hace no mucho el Kingdom Hearts 2 en FullHD en el PC. Y también es cierto que llevan demasiado tiempo armando con relanzamientos, recopilaciones y spin offs. Aún falta por confirmarse y lanzarse, que se hará, el Kingdom Hearts 2.5 HD Remix. Está casi confirmado ya que, en los créditos del 1.5 aparecen imágenes en HD del KH2 así como del Birth by Sleep y el Re: Coded.

Pero bueno, al menos harán más llevadera la espera a la ansiada tercera parte. Sin más os dejo con este segundo trailer.

Unboxing de mis nuevos Nexus 4 y 10

Hoy me ha llegado un pedido que hice ayer a la web de Google Play. Y es que, por lo visto, son super eficientes con los envíos. Un solo día para un pedido como este... Casi podría decir que increíble. 

Los paquetes, todo muy bien presentado xD.

 Comenzamos

 Aquí, el Nexus 4

Empezamos con el grande.

El Nexus 10

Los 3 hermanos.

Comparando con otro "smartphone"

Con su antecesor en el cargo.

Con PSVita.

 Recortando la Sim para convertirla en microSim.

Preguntas sin respuesta (sencilla) VI

¿Te gustaría ir a los fuegos artificiales?

E3 2013: Comienza el espectáculo

Un año más aquí estamos, preparados para una nueva entrega de la feria más importante de videojuegos del mundo. Mañana comienzan oficialmente las conferencias preE3 de las desarrolladoras de hardware, Microsoft, Sony y Nintendo (por ese orden de aparición).

Ya hemos podido ver algunas de las novedades que nos presentará la feria ya que, por ejemplo, Konami ya ha hecho su conferencia preE3 en la que nos ha dejado, entre otras cosas, un nuevo y extendido trailer del Castlevania Lord of Shadows 2, juego con el que concluye la saga Lord of Shadows. Aquí os dejo con el trailer por si queréis echarle un vistazo.

Por lo demás ¿qué espero yo de este E3? En primer lugar decir que este es el primer E3 en el que la 8ª generación de consolas ya está completa. Con sus integrantes (3DS, PSVita, WiiU, PS4 y Xbox Juan) preparadas para mostrar de qué son capaces.

Dicho así queda muy bonito ¿verdad? Pues lo cierto es que yo, de este E3 me espero las mismas decepciones de todos los años. Y es que esta feria va en caída libre los últimos años. Atrás quedan aquellas presentaciones que nos dejaban patidifusos delante de la pantalla del ordenador.

Supongo que el exponencial aumento de información del sector está asesinando vilmente a estas ferias ya que muy pocos anuncios consiguen mantenerse en secreto hasta las conferencias. Hay compañías que están aprendiendo a aprovecharse de esto, y la que mejor lo hace es, sin duda, Nintendo con sus Nintendo Direct. Este año ni siquiera va a tener una conferencia en el Kodak Theatre, decisión que, si bien me da un poco de pena, me parece acertada, ya que el año pasado la conferencia fue una basura y la Nintendo Direct posterior fue genial.

Sony y Microsoft, por su parte, están enzarzadas en una guerra entre ellas y contra los jugadores de la que solo salen reculando y ocultando. Ambas han presentado sus mayores bazas, las consolas, un mes antes del E3, algo que hasta ahora habría sido impensable. Son unas consolas oníricas, ya que de momento, y aunque se jactan de haberlas presentado, no son más que humo. Ninguna de las dos compañías se atreve a dar un paso, poniendo un precio o dando una fecha de lanzamiento, por miedo a lo que haga la otra.

Además ambas están cubiertas de rumores que van lanzando los propios creadores, como globos sonda, para ver la reacción de la gente. Que si van a tener conexión obligatoria a internet, que si no se permite la segunda mano, que si el online será o no de pago... y así miles de datos que siempre empiezan siendo malos para el público y se terminan suavizando o desmintiendo. Pero eso si, siempre de forma muy poco precisa, para poder dar una puñalada en cualquier momento.

El caso de Microsoft es el más sangrante ya que en su conferencia ni siquiera enseñó gameplays... pero bueno, ellos sabrán.

Así que si, mañana y pasado seguiré las conferencias, y trataré de realizar un seguimiento por aquí, como siempre. Pensados tengo varios especiales y demás cosas que siempre prometo, no se si podré cumplirlas o no. Las horas de espera para la conferencia de Sony dan para mucho si no me voy a la cama un rato xD. Pero las seguiré sin muchas esperanzas. De hecho no creo que salgamos del E3 ni con fecha ni con precio de las dos consolas que aún no han salido. Pero quién sabe, igual este año con lo que nos decepciona el E3 es precisamente con la decepción que esperamos...

Desperezándose ¿como un gato?

Murciélagos con cara de buena persona y transparencias... Si, creo que eso es lo más reseñable de mi día, y eso que ha sido completito. Dicho así suena bastante bizarro, pero en un día que ha tenido finales de plazos, bastantes "deberes", largas charlas con jefas que no son las mías, con felicitaciones incluidas, caminatas, problemas con programas de uso habitual, pseudobroca del jefe que termina en felicitaciones, incluso ahora mismo, mientras escribo esto, una actualización fantasma de Dropbox que, no se muy bien qué es lo que ha cambiado :S.

Y de todo el día, de todo esto, con lo que me quedo, o al menos, con lo que se queda mi cabeza, es con un brazo levantado y una sonrisa. Mi cerebro se toma en serio eso de que hay que quedarse con lo bello de la vida, y no ha habido nada más bello en todo el día. Dolorosa belleza, si, pero belleza al fin y al cabo.

Qué distinta sería esta realidad con una decisión diferente, una de muchas, un pequeño cambio... Pero no sería esta realidad, y por lo tanto yo no estaría preguntándome cómo sería ¿no?

Bueno, es hora de descansar, que mañana será otro día.

Me siento a tu vera, 

y siento que vuela 

lo siento de verás. 

Ahora tenerte de cerca 

me he dado cuenta que te he perdido, 

que ya no cuentas conmigo. 

Que todo te sabe mal, 

que no te lo crees, 

que es más de lo mismo. 

Hoy daría lo que fuera 

por tenerte a mi lado 

por seguirte siempre 

si tú quisieras. 

Tengo razones ya de sobra 

para andarme con historias 

es que te quiero y quiero estar contigo, 

siento que nada más me importa 

que me importas más que nada, 

el camino que sigo empieza y acaba… 

…contigo. 

Si en tus ojos yo me miro 

Si las palabras de tu boca, adivino… 

¿por qué no estar contigo? 

Siento sentirme tu amigo, 

quiero dejarlo estar 

me duele pensar 

lo que pudo haber sido . 

Hoy daría lo que fuera 

por tenerte a mi lado 

por seguirte siempre 

si tú quisieras. 

Tengo razones ya de sobra 

para andarme con historias 

es que te quiero y quiero estar contigo, 

siento que nada más me importa 

que me importas más que nada, 

el camino que sigo empieza y acaba… 

…contigo. 

Cuantas cosas en mi vida cambiaría 

cuanto mal que te ahorraría 

si pudiera amor. 

Loco de atar… por ti… 

si tú quisieras… 

si tú quisieras… 

Tengo razones ya de sobra 

para andarme con historias 

es que te quiero y quiero estar contigo, 

siento que nada más me importa 

que me importas más que nada, 

el camino que sigo empieza y acaba… 

…contigo. 

Contigo.. 

Si tú quisieras… 

Si tú quisieras…

Recordatorios de uno mismo

Hoy ha vuelto a ser uno de esos días en los que ele balance no debería ser... excesivamente negativo, y sin embargo llego a casa hecho mierda. ¿Por qué? Supongo que no hay una respuesta sencilla a esta pregunta, nunca hay una respuesta sencilla para esta pregunta. Y lo cierto es que ni yo mismo lo se. La sensación de abatimiento se cierne sobre mi, me acoge y me ata a las tinieblas.

Y digo que el balance no debería ser excesivamente negativo porque, aunque si que ha habido un par de actos hacía mi que no me han parecido nada bien, por lo general estoy satisfecho con mi trabajo, lo estaba... o, lo que sea.

Hoy he necesitado música, se me han hecho los "paseos" muy largos, demasiado. Demasiados temas en la cabeza que ni siquiera dejan pensar en las secuencias de DNA que debo analizar ni en ese tipo de cosas que habrían de tener importancia. 

He salido con un gran dolor de cabeza. Podría engañarme y convencerme a mi mismo que era por el tiempo, o por tratar con demasiados temas biológicos diferentes pero, por desgracia, se acercentó en el momento justo como para no tener excusas. Se bloquearon todos los pensamientos en uno solo después y... bueno, me conozco lo suficientemente bien como para negarlo.

En cualquier caso ¿qué debía haber hecho? Si, yo, como Kvothe, he estado a punto de olvidar algo, de pensar por un momento que el pasado no ha ocurrido que podría volver a... ... intentarlo. Pero no, eso es algo que ya no depende de mi, no depende de lo que yo quiera, sienta o piense. Ya no. El pasado no se puede olvidar.

Y si, ya se que sobrestimé mi aguante, subestimé el esfuerzo que requiere. No supe valorar lo desquiciante de la situación. Pero hace bastante que ya no depende de mi...

Preguntas sin respuesta sencilla V

¿Te apetece ir a dar un paseo?

Imaginando diálogos

Otra semana más que se pasa, de hecho, otro mes más, y como si nada. Ya estamos en Junio, mes de importantes eventos pero de eso tocará hablar otro día. El tiempo como cuarto eje de la realidad, sigue inexorable su avance y aceleración, si es que tiene sentido que un eje se acelere sin que se considere una trampa estadística.

El tiempo atmosférico, por su parte, parece que no quiere darse cuenta del momento en el que se encuentra ya que sigue haciendo un frío bastante importante, máxime teniendo en cuenta la época del año en la que nos encontramos. Aumentan los desastres naturales como una poética forma del planeta de mandarnos a tomar por culo.

Yo sigo teniendo mi necesidad de escribir, acuciante necesidad diría yo. Han vuelto a rodearme las oleadas de diálogos imaginados que parecía que se habían calmado un poco. Pero claro, plasmarlos como historias... Al final terminan teniendo la misma temática siempre ¿no?

Me gustaría decir que la gran tasa de ocupación que tengo últimamente contribuyen a que mi... "estabilidad mental" mejore pero supongo que estaría faltando a la verdad. Hace unos días volví a sentirme tan terriblemente débil, volví a quedarme absorto admirando...la. Y no es que sea algo que haya dejado de pasarme en algún momento, no. Tan solo es que no deja de sorprenderme lo absurdo de la situación.

Ahora mismo compruebo que, como otras veces que lo he intentado, me llega un bloqueo al tratar de tocar ciertos temas por aquí, es como si, de alguna manera, una barrera protectora tratara de mantener todo esto "a salvo". ¡Qué tontería! ¿no? Si al fin y al cabo....

Bueno, supongo que no importa...