jueves, 30 de agosto de 2018

Clusters a mansalva


Hacía tiempo que no ponía nada por aquí y me apetece dejar esta muestra de mi última carrera del HiSeq 4000 corriendo y con todos los clusters ordenaditos. Sigo alucinando, eso si, con la diferencia que supone cargar un NextSeq, en el que Illumina se centró en que sea fácil de usar, con uno de éstos bichos, que tienen muchos más pasos y, sobre todo, hay que tener mucho más cuidado y atención.
En esta hemos conseguido unos 3000 Millones de Reads que no está nada mal (bueno, de hecho está en el límite superior, este ya no da más de si xD). Unos 500 Gb de carrera una vez demultiplexada para 4 genomas humanos. El trabajo de muchos años ahora en pocas horas...
Una cosa si que está clara con los secuenciadores de Illumina, son piezas de ingeniería muy delicadas y deben estar en mantenimiento con la casa. En nuestro caso la tontería de un sensor en una de las puertas, que se había estropeado del uso normal, nos hizo repetir una carrera y tener parado el equipo hasta que solucionaron el problema. Eso si, todo muy eficientemente que para eso tienen las tarifas que tienen. No me quiero ni imaginar lo que hubiera supuesto esa ausencia de soporte, ya sólo por la reposición de la carrera, no hablemos de la reparación.
Y menos mal también que no es el único equipo del que disponemos porque esto no para. Pero bueno, como digo todo vuelve al máximo rendimiento. No se por qué os cuento estas cosas cuando simplemente quería compartir la foto xD.

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